試験研究費の法人税税額控除における当初申告要件の適用について

試験研究費に対する法人税の税額控除を受けるには、当初申告要件が必要と理解しています。

次のケースでは、税額控除を受けられるでしょうか。

・当初の確定申告書提出時は赤字であったため、税額控除は申請していない
・その後、税務調査により黒字となり、法人税等が発生した
・この法人税等に対して、税額控除を適用できるか

上記について確認したく、ご教示ください。