中小企業向け賃上げ促進税制における通勤交通費の取り扱いについて

中小企業向けの賃上げ促進税制における通勤交通費について確認したいです。

賃金台帳には通勤交通費の記載があり、図解シリーズの中小企業税制でも言及されていました。
一方で、賃金台帳に記載されていない通勤交通費については、この税制の適用対象から除外すべき、という理解でよろしいでしょうか。